MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017412	TA	3	6	22	27	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017412	T	6	6	46	51	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017412	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017412	ATTT	2	8	130	137	25 %	75 %	0 %	0 %	387826749
5	NC_017412	T	6	6	164	169	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
6	NC_017412	TCT	2	6	179	184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826749
7	NC_017412	A	6	6	233	238	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
8	NC_017412	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
9	NC_017412	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
10	NC_017412	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826749
11	NC_017412	ATT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826749
12	NC_017412	T	6	6	399	404	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
13	NC_017412	ATT	2	6	437	442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826749
14	NC_017412	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	387826749
15	NC_017412	TCT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826749
16	NC_017412	T	7	7	540	546	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
17	NC_017412	TATCTA	2	12	588	599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387826749
18	NC_017412	TAAAT	2	10	610	619	60 %	40 %	0 %	0 %	387826749
19	NC_017412	TAAAAA	2	12	622	633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826749
20	NC_017412	T	7	7	642	648	0 %	100 %	0 %	0 %	387826749
21	NC_017412	CTC	2	6	658	663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017412	TACT	2	8	732	739	25 %	50 %	0 %	25 %	387826750
23	NC_017412	TTC	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826750
24	NC_017412	AAT	2	6	831	836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826750
25	NC_017412	GCT	2	6	885	890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826750
26	NC_017412	ATTT	2	8	918	925	25 %	75 %	0 %	0 %	387826750
27	NC_017412	T	6	6	923	928	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
28	NC_017412	A	7	7	959	965	100 %	0 %	0 %	0 %	387826750
29	NC_017412	A	6	6	1026	1031	100 %	0 %	0 %	0 %	387826750
30	NC_017412	T	8	8	1074	1081	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
31	NC_017412	CTT	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826750
32	NC_017412	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
33	NC_017412	T	8	8	1156	1163	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
34	NC_017412	CAA	3	9	1195	1203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826750
35	NC_017412	TAA	3	9	1204	1212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826750
36	NC_017412	TAA	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826750
37	NC_017412	T	7	7	1227	1233	0 %	100 %	0 %	0 %	387826750
38	NC_017412	AC	3	6	1240	1245	50 %	0 %	0 %	50 %	387826750
39	NC_017412	TATAA	2	10	1254	1263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017412	TACAC	2	10	1266	1275	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017412	ACAAA	2	10	1279	1288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017412	AAG	2	6	1336	1341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017412	TTATAC	2	12	1394	1405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387826751
44	NC_017412	TTC	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
45	NC_017412	AAT	2	6	1416	1421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826751
46	NC_017412	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
47	NC_017412	T	6	6	1462	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
48	NC_017412	TAA	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826751
49	NC_017412	TCT	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
50	NC_017412	ATT	2	6	1546	1551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
51	NC_017412	TTTTCT	2	12	1556	1567	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826751
52	NC_017412	TCT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
53	NC_017412	AAGTA	2	10	1640	1649	60 %	20 %	20 %	0 %	387826751
54	NC_017412	TTC	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
55	NC_017412	CAT	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826751
56	NC_017412	AGC	2	6	1792	1797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826751
57	NC_017412	A	6	6	1817	1822	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
58	NC_017412	AACA	2	8	1852	1859	75 %	0 %	0 %	25 %	387826751
59	NC_017412	T	6	6	1861	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
60	NC_017412	TCT	2	6	2039	2044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
61	NC_017412	CTTT	2	8	2069	2076	0 %	75 %	0 %	25 %	387826751
62	NC_017412	A	6	6	2092	2097	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
63	NC_017412	AT	3	6	2139	2144	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
64	NC_017412	TCA	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826751
65	NC_017412	ATT	2	6	2182	2187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
66	NC_017412	TCT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
67	NC_017412	CAA	2	6	2265	2270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826751
68	NC_017412	TAT	2	6	2299	2304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
69	NC_017412	TTTGA	2	10	2329	2338	20 %	60 %	20 %	0 %	387826751
70	NC_017412	CAATT	2	10	2347	2356	40 %	40 %	0 %	20 %	387826751
71	NC_017412	TTTC	2	8	2400	2407	0 %	75 %	0 %	25 %	387826751
72	NC_017412	TAA	2	6	2427	2432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826751
73	NC_017412	TGT	2	6	2452	2457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826751
74	NC_017412	T	6	6	2523	2528	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
75	NC_017412	AT	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
76	NC_017412	CAC	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826751
77	NC_017412	TAAGT	2	10	2630	2639	40 %	40 %	20 %	0 %	387826751
78	NC_017412	CAC	3	9	2700	2708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826751
79	NC_017412	ATT	2	6	2740	2745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
80	NC_017412	T	7	7	2762	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
81	NC_017412	GAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826751
82	NC_017412	TTTTA	2	10	2821	2830	20 %	80 %	0 %	0 %	387826751
83	NC_017412	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
84	NC_017412	TCA	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826751
85	NC_017412	GGA	2	6	2915	2920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826751
86	NC_017412	CTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
87	NC_017412	A	6	6	2977	2982	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
88	NC_017412	GCT	2	6	2992	2997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826751
89	NC_017412	T	6	6	3001	3006	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
90	NC_017412	T	6	6	3009	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
91	NC_017412	T	6	6	3018	3023	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
92	NC_017412	TCG	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826751
93	NC_017412	TTAA	2	8	3137	3144	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
94	NC_017412	ATT	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
95	NC_017412	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
96	NC_017412	TAG	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826751
97	NC_017412	T	6	6	3252	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
98	NC_017412	GATA	2	8	3258	3265	50 %	25 %	25 %	0 %	387826751
99	NC_017412	TCT	2	6	3266	3271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
100	NC_017412	T	6	6	3296	3301	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
101	NC_017412	AGC	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826751
102	NC_017412	TGG	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826751
103	NC_017412	T	6	6	3562	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
104	NC_017412	T	8	8	3606	3613	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
105	NC_017412	ATT	2	6	3707	3712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
106	NC_017412	TTC	2	6	3745	3750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
107	NC_017412	CCG	2	6	3753	3758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387826751
108	NC_017412	TCT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
109	NC_017412	CAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826751
110	NC_017412	T	8	8	3807	3814	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
111	NC_017412	TAG	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826751
112	NC_017412	TAG	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826751
113	NC_017412	T	6	6	4033	4038	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
114	NC_017412	TTTC	2	8	4049	4056	0 %	75 %	0 %	25 %	387826751
115	NC_017412	AGA	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826751
116	NC_017412	TTC	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
117	NC_017412	ACT	3	9	4096	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826751
118	NC_017412	ATT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
119	NC_017412	TCC	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826751
120	NC_017412	A	6	6	4178	4183	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
121	NC_017412	TAT	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826751
122	NC_017412	T	7	7	4221	4227	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
123	NC_017412	T	6	6	4241	4246	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
124	NC_017412	TCA	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826751
125	NC_017412	A	8	8	4260	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
126	NC_017412	TA	3	6	4290	4295	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
127	NC_017412	AAG	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826751
128	NC_017412	AT	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
129	NC_017412	A	6	6	4351	4356	100 %	0 %	0 %	0 %	387826751
130	NC_017412	AAT	2	6	4372	4377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826751
131	NC_017412	TTC	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826751
132	NC_017412	AT	4	8	4447	4454	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
133	NC_017412	T	6	6	4454	4459	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
134	NC_017412	GTC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826751
135	NC_017412	AT	3	6	4502	4507	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
136	NC_017412	T	6	6	4515	4520	0 %	100 %	0 %	0 %	387826751
137	NC_017412	TC	3	6	4525	4530	0 %	50 %	0 %	50 %	387826751
138	NC_017412	TCA	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826751
139	NC_017412	A	9	9	4636	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017412	A	8	8	4660	4667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017412	CATC	2	8	4674	4681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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282	NC_017412	AGC	2	6	9853	9858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826757
283	NC_017412	T	7	7	9869	9875	0 %	100 %	0 %	0 %	387826757
284	NC_017412	T	6	6	9886	9891	0 %	100 %	0 %	0 %	387826757
285	NC_017412	T	7	7	9906	9912	0 %	100 %	0 %	0 %	387826757
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403	NC_017412	TGAA	2	8	16148	16155	50 %	25 %	25 %	0 %	387826766
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